当酥饼机在工作时发现有物料（无论是酥饼原料、残留物还是其他异物），应该按照以下步骤进行处理：

1. 立即停机：一旦发现酥饼机内有异常物料，首先要立即停止机器的运行，防止物料进一步影响生产流程或酥饼质量。

2. 评估物料情况：观察并判断物料是什么，以及它如何进入酥饼机的。这有助于确定下一步的处理措施。

3. 清理和排除：

• 如果是酥饼原料的残留物或溢出物，应使用适当的工具和方法小心清理，避免对设备造成损坏。

• 如果是其他异物，如工具、纸张或其他污染物，应立即清除并找到来源，避免再次发生。

4. 检查设备：清理完物料后，检查酥饼机是否有损坏或需要调整的地方。如果是因为设备故障导致物料问题，需要及时维修。

5. 重新启动：在确认设备没有问题并且已经彻底清洁后，重新启动酥饼机进行生产。

6. 检查后续产品：在机器重新启动后，应检查第一批生产出的酥饼是否有问题。如果发现问题，应进一步调查原因并进行处理。

7. 预防措施：

• 加强员工培训，确保他们了解如何正确操作酥饼机，并遵循食品安全和卫生规定。

• 定期对酥饼机进行维护和保养，确保其正常运行，减少故障发生的可能性。

• 加强生产现场的清洁和消毒工作，保持工作区域的整洁和卫生。

• 定期检查原料和半成品，确保它们没有受到污染或损坏。

通过遵循以上步骤和预防措施，可以有效地处理酥饼机工作时发现的物料问题，确保酥饼生产的顺利进行和产品质量。